Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CYTH1Q15438 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CYTH1Q15438 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CYTH1Q15438 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CYTH1Q15438 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CYTH1Q15438 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CYTH1Q15438 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CYTH1Q15438 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CYTH1Q15438 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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CYTH1Q15438 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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CYTH1Q15438 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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CYTH1Q15438 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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CYTH1Q15438 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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CYTH1Q15438 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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CYTH1Q15438 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CYTH1Q15438 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CYTH1Q15438 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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