Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEC23AQ15436 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23AQ15436 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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