Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
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PTPRKQ15262 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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PTPRKQ15262 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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PTPRKQ15262 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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PTPRKQ15262 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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PTPRKQ15262 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPRKQ15262 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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