Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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PRKD1Q15139 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PRKD1Q15139 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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PRKD1Q15139 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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PRKD1Q15139 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRKD1Q15139 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRKD1Q15139 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRKD1Q15139 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRKD1Q15139 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PRKD1Q15139 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PRKD1Q15139 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRKD1Q15139 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PRKD1Q15139 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PRKD1Q15139 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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PRKD1Q15139 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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PRKD1Q15139 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRKD1Q15139 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRKD1Q15139 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PRKD1Q15139 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PRKD1Q15139 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PRKD1Q15139 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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