Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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