Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GBX1Q14549 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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GBX1Q14549 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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