Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
UBE4AQ14139 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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UBE4AQ14139 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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UBE4AQ14139 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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UBE4AQ14139 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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UBE4AQ14139 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
UBE4AQ14139 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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