Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SHROOM2Q13796 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SHROOM2Q13796 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms