Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RUNX3Q13761 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RUNX3Q13761 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms