Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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SNX1Q13596 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SNX1Q13596 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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SNX1Q13596 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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SNX1Q13596 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SNX1Q13596 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX1Q13596 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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