| NEUROD1 | Q13562 | RNU1-22P-201 | ENST00000363334 | 158 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.348-201 | ENST00000365403 | 103 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR624-201 | ENST00000385217 | 97 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP127-201 | ENST00000411051 | 133 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | HMGN2P32-201 | ENST00000444648 | 269 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL031183.1-201 | ENST00000457667 | 207 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | UBE2DNL-203 | ENST00000474922 | 222 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC005336.3-201 | ENST00000623833 | 2679 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AGTPBP1-205 | ENST00000376083 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MUC15-201 | ENST00000281268 | 2968 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP456-201 | ENST00000364002 | 114 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1107P-201 | ENST00000364817 | 104 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU2-32P-201 | ENST00000411193 | 191 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | CALM2P4-201 | ENST00000430810 | 426 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP82-201 | ENST00000516707 | 92 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-965P-201 | ENST00000516721 | 96 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC018630.3-201 | ENST00000542637 | 96 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC011604.1-201 | ENST00000545978 | 196 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ZNF720P1-201 | ENST00000562403 | 1939 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR5092-201 | ENST00000583139 | 88 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC023490.1-201 | ENST00000614584 | 375 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | U4.3-201 | ENST00000621047 | 82 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC011718.1-201 | ENST00000622906 | 375 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SENP7-205 | ENST00000394091 | 4434 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ATF1-201 | ENST00000262053 | 2181 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | DNAH14-210 | ENST00000439375 | 13548 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR449A-201 | ENST00000362113 | 91 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORD31B-201 | ENST00000364977 | 69 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA51.10-201 | ENST00000384418 | 136 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.528-201 | ENST00000384575 | 108 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL135790.1-201 | ENST00000427161 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC023449.1-201 | ENST00000454464 | 154 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORA59A-201 | ENST00000459326 | 152 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP236-201 | ENST00000516169 | 116 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC103810.1-201 | ENST00000579873 | 453 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ROCK2-203 | ENST00000401753 | 4017 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SKIL-203 | ENST00000426052 | 2757 nt | TSL 2 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU1-72P-201 | ENST00000362976 | 153 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORD114-30-201 | ENST00000364448 | 72 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP125-201 | ENST00000364843 | 120 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | U8.6-201 | ENST00000364939 | 135 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | TRDJ2-201 | ENST00000390475 | 54 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AF228730.3-201 | ENST00000436691 | 102 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | OR9P1P-201 | ENST00000496431 | 281 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC010255.2-201 | ENST00000505209 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC097462.1-201 | ENST00000514125 | 324 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-948P-201 | ENST00000516374 | 107 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR4765-201 | ENST00000585007 | 77 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR4438-201 | ENST00000585271 | 93 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL365205.2-201 | ENST00000594586 | 68 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | OSBPL1A-217 | ENST00000638614 | 84 nt | TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | DPY19L2P1-203 | ENST00000458672 | 3347 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RTL4-201 | ENST00000340433 | 2613 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AGL-204 | ENST00000370161 | 6923 nt | TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNA5SP289-201 | ENST00000362332 | 137 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.281-201 | ENST00000364774 | 94 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1131P-201 | ENST00000364955 | 107 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1240P-201 | ENST00000365155 | 104 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR1302-4-201 | ENST00000408701 | 150 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | NDUFA4P2-201 | ENST00000489989 | 244 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU7-172P-201 | ENST00000517125 | 64 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC007012.1-201 | ENST00000567192 | 175 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR2681-201 | ENST00000581814 | 105 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC046143.2-201 | ENST00000609789 | 160 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC009831.4-201 | ENST00000620744 | 325 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR1248-201 | ENST00000629190 | 106 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | ETDC-201 | ENST00000635820 | 180 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SLC27A2-203 | ENST00000544960 | 2025 nt | TSL 2 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | DENND4A-202 | ENST00000443035 | 8665 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC130466.1-201 | ENST00000636354 | 4683 nt | TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU1-51P-201 | ENST00000365345 | 176 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1138P-201 | ENST00000365359 | 106 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.388-201 | ENST00000383919 | 113 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-49P-201 | ENST00000384256 | 107 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SNORD12C-201 | ENST00000386307 | 89 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC009414.1-201 | ENST00000427200 | 443 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RPS12P2-201 | ENST00000439728 | 269 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SCARNA17.1-201 | ENST00000516211 | 143 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SCARNA17.2-201 | ENST00000516334 | 143 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-762P-201 | ENST00000517107 | 102 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1270P-201 | ENST00000517128 | 108 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | SCARNA17.4-201 | ENST00000614296 | 143 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL591926.4-201 | ENST00000616895 | 298 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | NPPA-AS1_2.1-201 | ENST00000618496 | 149 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC006435.5-201 | ENST00000624486 | 112 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | CCDC148-202 | ENST00000409187 | 2523 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-1235P-201 | ENST00000384559 | 107 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL359511.1-201 | ENST00000402970 | 211 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL513477.1-202 | ENST00000417061 | 214 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC093423.2-201 | ENST00000429074 | 437 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-498P-201 | ENST00000459468 | 107 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | CFAP44-AS1-201 | ENST00000473329 | 396 nt | TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AC026436.1-201 | ENST00000510537 | 270 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MRPS36P2-201 | ENST00000512569 | 299 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-365P-201 | ENST00000517113 | 106 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | U6.73-201 | ENST00000619194 | 103 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | AL035470.1-201 | ENST00000622571 | 220 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | MIR21-201 | ENST00000362134 | 72 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | Y_RNA.85-201 | ENST00000363014 | 111 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| NEUROD1 | Q13562 | RNU6-294P-201 | ENST00000364999 | 102 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |