Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DUSP4Q13115 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DUSP4Q13115 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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