Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
IFT88Q13099 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
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IFT88Q13099 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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IFT88Q13099 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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IFT88Q13099 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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IFT88Q13099 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
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IFT88Q13099 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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