Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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GPS1Q13098 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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GPS1Q13098 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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GPS1Q13098 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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GPS1Q13098 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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GPS1Q13098 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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GPS1Q13098 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GPS1Q13098 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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