Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CNTN1Q12860 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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CNTN1Q12860 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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CNTN1Q12860 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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CNTN1Q12860 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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CNTN1Q12860 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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CNTN1Q12860 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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CNTN1Q12860 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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CNTN1Q12860 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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CNTN1Q12860 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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CNTN1Q12860 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CNTN1Q12860 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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