Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
APOBRQ0VD83 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
APOBRQ0VD83 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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