Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HOXD10P28358 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
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HOXD10P28358 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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HOXD10P28358 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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HOXD10P28358 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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HOXD10P28358 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
HOXD10P28358 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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