Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
VPREB1P12018 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
VPREB1P12018 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms