Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LRRTM2O43300 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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