Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS1O00470 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS1O00470 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.9 ms