Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CAPN6Q9Y6Q1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CAPN6Q9Y6Q1 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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