Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.53□□□□□ -2
USP35Q9P2H5 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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USP35Q9P2H5 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
USP35Q9P2H5 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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