Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FAM53CQ9NYF3 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms