Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
CIPCQ9C0C6 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CIPCQ9C0C6 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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