Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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FOXQ1Q9C009 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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FOXQ1Q9C009 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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FOXQ1Q9C009 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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FOXQ1Q9C009 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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FOXQ1Q9C009 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXQ1Q9C009 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXQ1Q9C009 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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