Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SSBP4Q9BWG4 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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