Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
ATG4CQ96DT6 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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ATG4CQ96DT6 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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ATG4CQ96DT6 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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ATG4CQ96DT6 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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ATG4CQ96DT6 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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ATG4CQ96DT6 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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ATG4CQ96DT6 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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ATG4CQ96DT6 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATG4CQ96DT6 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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