Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPROQ16827 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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PTPROQ16827 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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PTPROQ16827 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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PTPROQ16827 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPROQ16827 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPROQ16827 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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PTPROQ16827 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPROQ16827 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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