Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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LAMA3Q16787 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
LAMA3Q16787 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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