Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC1Q16533 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC1Q16533 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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