Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SIX1Q15475 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SIX1Q15475 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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