Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SEC23BQ15437 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
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SEC23BQ15437 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SEC23BQ15437 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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