Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PDCD1Q15116 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PDCD1Q15116 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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