Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KARSQ15046 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KARSQ15046 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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