Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NR1I3Q14994 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1I3Q14994 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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