Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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RAB39AQ14964 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
RAB39AQ14964 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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RAB39AQ14964 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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RAB39AQ14964 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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RAB39AQ14964 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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RAB39AQ14964 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RAB39AQ14964 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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