Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2CQ14957 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GRIN2CQ14957 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms