Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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CKAP5Q14008 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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CKAP5Q14008 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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CKAP5Q14008 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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CKAP5Q14008 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CKAP5Q14008 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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CKAP5Q14008 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CKAP5Q14008 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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