Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGA9Q13797 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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ITGA9Q13797 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGA9Q13797 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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