Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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ATP1A4Q13733 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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ATP1A4Q13733 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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ATP1A4Q13733 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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ATP1A4Q13733 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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ATP1A4Q13733 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP1A4Q13733 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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