Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTCH1Q13635 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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PTCH1Q13635 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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PTCH1Q13635 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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PTCH1Q13635 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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PTCH1Q13635 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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PTCH1Q13635 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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PTCH1Q13635 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTCH1Q13635 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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