Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CUL1Q13616 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CUL1Q13616 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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