Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
BFSP2Q13515 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
BFSP2Q13515 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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