Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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TCIRG1Q13488 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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TCIRG1Q13488 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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TCIRG1Q13488 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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TCIRG1Q13488 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TCIRG1Q13488 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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