Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MKRN3Q13064 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
MKRN3Q13064 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
MKRN3Q13064 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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