Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK2Q13002 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK2Q13002 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.8 ms