Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
EFEMP1Q12805 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
EFEMP1Q12805 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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