Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SDSP20132 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SDSP20132 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SDSP20132 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SDSP20132 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SDSP20132 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SDSP20132 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SDSP20132 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SDSP20132 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SDSP20132 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SDSP20132 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SDSP20132 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SDSP20132 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SDSP20132 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SDSP20132 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms