Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
COPS7AQ9UBW8 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
COPS7AQ9UBW8 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms