Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
EHD3Q9NZN3 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
EHD3Q9NZN3 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms